Descubierto un nuevo gen de resistencia a los antibi¨®ticos oculto en el microbioma

Una investigaci¨®n apunta que el ecosistema de microbios que hay en el intestino puede ser un reservorio de genes resistentes que saltan de una bacteria a otra

Bruno Gonz¨¢lez-Zorn, director de la Unidad de Resistencia a los Antibi¨®ticos de la Universidad Complutense de Madrid, y asesor de la OMS, en su despacho de la universidad.Jaime Villanueva

El microbioma es todav¨ªa una caja de sorpresas para la ciencia. Ese inmenso ecosistema de microbios (virus, bacterias y hongos, entre otros) que puebla el intestino y otras partes del organismo, ayuda al ser humano en funciones tan elementales como protegerse frente a pat¨®genos externos o metabolizar algunos alimentos. Pero la comunidad cient¨ªfica sigue intentando describir con nitidez todo lo que ah¨ª ocurre y c¨®mo se comportan exactamente los habitantes de ese peque?o gran mundo viviente. Un estudio reci¨¦n publicado en la revista International Journal of Antimicrobial Agents, ha ahondado en las profundidades de ese universo microbiano y ha descubierto un nuevo gen de resistencia a los antibi¨®ticos oculto en bacterias del microbioma. La investigaci¨®n apunta que ese universo microbiano que hay en el intestino puede ser un reservorio de genes resistentes con capacidad de saltar de una bacteria a otra.

El hallazgo alumbra un nuevo rinc¨®n desconocido del complejo microbioma humano y arroja, a la vez, conocimiento sobre una de las mayores amenazas contra la salud que afronta el mundo moderno: las superbacterias. Los microbios resistentes a los antibi¨®ticos causan 1,7 millones de muertes al a?o en el globo y, seg¨²n una proyecci¨®n publicada en la revista The Lancet el pasado septiembre, podr¨ªan matar en el pr¨®ximo cuarto de siglo a m¨¢s de 39 millones de personas de forma directa y a 169 millones indirectamente (por asociaci¨®n con otras patolog¨ªas).

La investigaci¨®n identific¨® un nuevo gen (npmC) con capacidad de neutralizar la acci¨®n de los aminogluc¨®sidos, una familia de antibi¨®ticos utilizados para tratar infecciones bacterianas graves. Los cient¨ªficos encontraron esta enzima en un lugar inh¨®spito en microbiomas humanos y animales en China y en Canad¨¢: estaba oculta en bacterias no cultivables cuyos genomas completos se desconocen. ¡°El 98% de las bacterias del mundo no las podemos cultivar, no podemos hacerlas crecer en el laboratorio por diversos motivos (porque tardan meses en crecer, porque se alimentan de otras bacterias, porque las condiciones del laboratorio les son t¨®xicas...). Las conocemos solo por la informaci¨®n gen¨®mica [parcial] que extraemos de las heces¡±, explica el autor de estudio, Bruno Gonz¨¢lez-Zorn, director de la Unidad de Resistencias Antimicrobianas de la Universidad Complutense de Madrid y asesor de la Organizaci¨®n Mundial de la Salud (OMS) en este campo.

A partir de esos datos gen¨®micos de funci¨®n desconocida recolectados en muestras animales y humanas de China y Canad¨¢, los investigadores pudieron sintetizar en el laboratorio esas secuencias parciales de genes y estudiar y entender su comportamiento. ¡°Vimos que expresando esos genes en una bacteria en el laboratorio confieren altos niveles de resistencia a esta familia de antibi¨®ticos, los aminogluc¨®sidos, que se usan mucho en las unidades de cuidados intensivos¡±, expone el cient¨ªfico. En concreto, lo que hace este gen, puntualiza el microbi¨®logo, es poner en el ribosoma, que es una estructura de la c¨¦lula bacteriana, una mol¨¦cula (un grupo metilo) que impide f¨ªsicamente que esos antibi¨®ticos se unan al ribosoma y hagan su funci¨®n antibacteriana.

¡°Estamos empezando a descubrir la materia oscura del intestino. El microbioma es un reservorio de genes de resistencia antibi¨®tica por descubrir¡±, asegura Gonz¨¢lez-Zorn. Los investigadores est¨¢n analizando nuevas familias de genes con capacidad de sortear el efecto de los antibi¨®ticos y, seg¨²n el microbi¨®logo de la UCM, ya hay grupos cient¨ªficos internacionales que trabajan ¡°para impedir que se cree ese grupo metilo o para resensibilizar esa bacteria¡±.

M¨¢s vigilancia gen¨®mica

Quedan, no obstante, muchos misterios por desvelar en torno al papel que juega el microbioma en las resistencias a los antibi¨®ticos, admite el experto: ¡°Las t¨¦cnicas todav¨ªa no nos permiten conocer en profundidad la composici¨®n del microbioma humano. No se conoce el genoma entero de todas las bacterias o de bacterias que est¨¢n presentes en muy poca cantidad¡±. En este sentido, el microbi¨®logo pone el foco en reforzar la vigilancia gen¨®mica para atajar una de las grandes amenazas globales a la salud: ¡°El hallazgo de NpmC como un nuevo mecanismo de resistencia a los aminogluc¨®sidos es una llamada de atenci¨®n para intensificar la vigilancia gen¨®mica y reforzar las estrategias globales de control de la resistencia antimicrobiana desde la perspectiva One Health [un enfoque integral para equilibrar y optimizar la salud humana, animal y medioambiental]¡±.

Mar¨ªa del Mar Tom¨¢s, microbi¨®loga del Complexo Hospitalario Universitario de A Coru?a y portavoz de la Sociedad Espa?ola de Infecciosas y Microbiolog¨ªa Cl¨ªnica (SEIMC), destaca que el nuevo gen de resistencia antibi¨®tica descubierto ¡°se ha encontrado en bacterias no pat¨®genas y hay que tener en cuenta que puede llegar al ¨¢mbito cl¨ªnico¡±. Es decir, saltar de una bacteria no nociva a una pat¨®gena y convertir a ese microbio causante de infecciones en resistente a esa familia de antibi¨®ticos. ¡°Es muy dif¨ªcil evitar que este gen termine llegando a la cl¨ªnica, pero este estudio puede servir para el desarrollo de nuevos aminogluc¨®sidos o antibi¨®ticos que eviten este mecanismo de resistencia. Tambi¨¦n es necesario analizar cu¨¢les son los elementos m¨®viles que pueden transmitir este gen de una bacteria a otra para evitar la transmisi¨®n. Pero se requieren m¨¢s estudios del entorno gen¨®mico de este gen¡±, reflexiona la microbi¨®loga, que no ha participado en esta investigaci¨®n.

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