La supercomputaci¨® far¨¤ m¨¦s assequible el tractament del c¨¤ncer

Fa alguns anys, no era estrany sentir que algunes celebritats amb c¨¤ncer viatjaven fins a Houston (EUA) per posar-se en mans dels millors especialistes en la malaltia. Aquells metges serien capa?os d'oferir el diagn¨°stic m¨¦s prec¨ªs i recomanar el tractament m¨¦s adequat. El prestigi de la sanitat espanyola ha fet menys populars aquells viatges, per¨° les difer¨¨ncies entre els professionals d'uns centres i altres a Espanya fa que les variacions en superviv¨¨ncia entre hospitals del mateix pa¨ªs encara siguin importants.

Ara, un nou avan? que acaba de presentar un equip liderat pel Centre de Supercomputaci¨® de Barcelona pot ajudar a dissenyar tractaments m¨¦s personalitzats contra el c¨¤ncer i fer-ho d'una manera m¨¦s automatitzada, de manera que sense disposar dels millors especialistes es pugui aspirar a obtenir els millors resultats.

La base d'aquest sistema seria l'SMUFIN, un m¨¨tode computacional capa? de detectar alteracions gen¨¨tiques relacionades amb l'aparici¨® de tumors que ara com ara es podr¨¤ aplicar al camp de la investigaci¨®. Aquest m¨¨tode, que avui publica?la revista Nature Biotechnology, permet comparar el genoma de c¨¨l¡¤lules sanes d'un pacient amb el de les seves c¨¨l¡¤lules canceroses. Amb aquesta informaci¨®, ¨¦s possible identificar les mutacions d'un tumor concret que s¨®n responsables de l'aparici¨® de la malaltia.

El tractament per a un c¨¤ncer com el de mama no ¨¦s ¨²nic

Aix¨° permetria aplicar un tractament dissenyat m¨¦s o menys a mida per a un tipus de c¨¤ncer d'una persona, perqu¨¨ la variabilitat i capacitat d'adaptaci¨® de les c¨¨l¡¤lules cancer¨ªgenes fa que no nom¨¦s es requereixin tractaments diferents per tractar tumors diferents, com el de pulm¨® o de p¨¤ncrees, sin¨® que els c¨¤ncers que afecten un mateix ¨°rgan poden reaccionar de manera diferent a un mateix tractament.

"Entre totes les persones que tinguin un tumor de mama, cadascuna tindr¨¤ un origen diferent i ¨¦s clau con¨¨ixer aquest origen per desenvolupar ter¨¤pies espec¨ªfiques per a cada persona", explica David Torrents, professor d'investigaci¨® ICREA al BSC i autor principal del treball. Aquest tipus de tecnologia ¨¦s un pas cap a la medicina personalitzada, que milloraria els resultats de tractaments actuals com la quimioter¨¤pia, que danyen el c¨¤ncer per¨° tamb¨¦ les c¨¨l¡¤lules sanes.

Amb aquest nou enfocament, a un pacient diagnosticat de c¨¤ncer se li extraurien c¨¨l¡¤lules sanes i c¨¨l¡¤lules del tumor, se seq¨¹enciaria el genoma dels dos tipus de c¨¨l¡¤lules i es compararia per identificar quins tumors han provocat el c¨¤ncer. Segons si la mutaci¨® afect¨¦s un gen o un altre, aquesta informaci¨® s'utilitzaria per triar el f¨¤rmac m¨¦s efica? per actuar contra aquesta diana concreta. "Ara, tamb¨¦ ¨¦s tasca de les farmac¨¨utiques trobar aquests f¨¤rmacs m¨¦s espec¨ªfics per poder-los aplicar a cada tipus de diana", apunta Torrents.

D'una setmana a cinc hores

Fins ara, aquest tipus d'an¨¤lisis eren possibles, per¨° estudiar un sol tumor podia significar invertir-hi fins a una setmana. "Nosaltres ho estem fent ara entre cinc i deu hores", afirma Torrents. A m¨¦s, amb l'SMUFIN es poden detectar canvis en el genoma que per a sistemes d'an¨¤lisis anteriors quedaven ocults.

Els m¨¨todes anteriors eren m¨¦s costosos i requerien molt personal, en particular inform¨¤tic. "Per fer el salt a la cl¨ªnica era necessari guanyar en rapidesa, senzillesa i flexibilitat", assenyala Torrents. L'SMUFIN, segons els autors, facilitar¨¤ aplicar la tecnologia de seq¨¹enciaci¨® i comparaci¨® de genomes a centres que no disposin d'experts en inform¨¤tica ni de grans recursos computacionals.

Finalment, la informaci¨® sobre les mutacions d'una c¨¨l¡¤lula tumoral es podr¨¤ creuar amb una base de dades que indiqui quins f¨¤rmacs s¨®n m¨¦s efica?os per mitigar els canvis que produeixen aquestes mutacions i acaben desembocant en un c¨¤ncer. Aquesta etapa, que va m¨¦s enll¨¤ de l'article publicat avui, a banda de millorar la medicina personalitzada, posaria a disposici¨® de molta m¨¦s gent i a un preu molt m¨¦s baix diagn¨°stics precisos per a cada malaltia particular.