El transporte p¨²blico en Latinoam¨¦rica tiene la mayor presencia de microbios resistentes

Los an¨¢lisis de bacterias, virus y hongos presentes en los sistemas de trasporte urbano y los ferrocarriles metropolitanos de 58 ciudades de todo el mundo han hallado que la zona con mayor prevalencia de estos organismos resistentes a los antimicrobianos (RAM) es Latinoam¨¦rica. Un equipo internacional compuesto por 600 investigadores ha tomado 3.741 muestras de las barandillas, las m¨¢quinas de venta de billetes y las paredes de las estaciones del metro a fin de crear un "atlas" de comunidades urbanas de microorganismos.

Los cient¨ªficos utilizaron las muestras para identificar las bacterias, los virus y los hongos ?conocidos en su conjunto como microbiota? de esos espacios urbanos y estudiar las variaciones de las caracter¨ªsticas gen¨¦ticas y la resistencia a los antibi¨®ticos.

En total se identificaron 4.424 especies conocidas, 1.145 de las cuales se detectaron en m¨¢s del 70% de las muestras. 61 especies presentes en m¨¢s del 95% de las muestras no forman parte de la microbiota humana normal que puebla la piel y las v¨ªas respiratorias, ni tampoco el suelo. El estudio, realizado por un consorcio de cient¨ªficos de ?frica, Am¨¦rica, Asia, Europa y Australasia, se public¨® en BioRxiv, un repositorio de acceso abierto para trabajos a¨²n no impresos que permite a los autores poner sus descubrimientos al alcance de la comunidad cient¨ªfica de manera inmediata.

Eduardo Castro-Nallar, coautor del art¨ªculo e investigador del Centro de Bioinform¨¢tica y Bilog¨ªa Integrativa de la Universidad Andr¨¦s Bello de Santiago de Chile, explica que "esto ha llevado a pensar que las ciudades son un ecosistema en s¨ª mismas, con una comunidad de microorganismos estable". Adem¨¢s, el estudio comprob¨® que m¨¢s del 50% de las muestras gen¨¦ticas recogidas no se pod¨ªan identificar, lo que significa que hay microorganismos que la ciencia no conoce o no ha definido.

En Latinoam¨¦rica, los investigadores tomaron muestras del metro y los sistemas de transporte urbano de S?o Paulo, R¨ªo de Janeiro, Bogot¨¢ y Santiago. La prevalencia de los genes RAM que se encontraron en estos entornos era entre 10 y 20 veces superior a la de ciudades de otras zonas del mundo. R¨ªo de Janeiro y Bogot¨¢, por ejemplo, ten¨ªan 10 veces m¨¢s genes RAM que Par¨ªs, Baltimore o Singapur.

El estudio tambi¨¦n mostr¨® que la naturaleza de las unidades RAM y la distribuci¨®n de genes var¨ªa entre ciudades. "Aunque muchos microorganismos est¨¢n presentes en gran n¨²mero de ciudades, existe una especie de sello microbiano que identifica a cada una de ellas. Se podr¨ªa tomar una muestra, analizarla, y adivinar su procedencia", resume Castro-Nallar, que tambi¨¦n es investigador en el Instituto de Biolog¨ªa Computacional de la Universidad George Washington.

El estudio comprob¨® que m¨¢s del 50% de las muestras gen¨¦ticas recogidas no se pod¨ªan identificar, lo que significa que hay microorganismos que la ciencia no conoce o no ha definido

"Mientras que algunas muestras solamente contienen unos cuantos genes RAM, en otras los hay en gran cantidad, lo cual tiene repercusiones no solo para nuestro conocimiento del desarrollo de las ciudades, sino tambi¨¦n para la planificaci¨®n urbana", afirma.

Los cient¨ªficos consideran que este hecho es una muestra de la necesidad de utilizar mejor los antibi¨®ticos en Latinoam¨¦rica, y a?aden: "Los resultados de nuestro art¨ªculo indican que la prevalencia de los genes RAM es muy alta, superada solo por Offa, en Nigeria".

Cristina Marino Buslje, investigadora de la Unidad de Bioinform¨¢tica Estructural de la Fundaci¨®n Instituto Leloir, de Buenos Aires, que no particip¨® en el trabajo, opina que "es un estudio sin precedentes, posible gracias a los avances t¨¦cnicos que permiten construir la secuencia gen¨¦tica y a los an¨¢lisis por ordenador de cantidades enormes de datos. "Espero que las autoridades gubernamentales tengan en cuenta los datos generados por ¨¦l a la hora de tomar decisiones en materia de pol¨ªtica sanitaria. El trabajo tambi¨¦n puede ayudar a los profesionales de la sanidad en el diagn¨®stico y el tratamiento de las infecciones", dice.

Virgina Pasquinelli, de la Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires, a?ade: "Este trabajo no solo aporta nueva informaci¨®n, sino que tambi¨¦n proporciona herramientas de uso libre para el an¨¢lisis del microbioma urbano. El objetivo final es construir una base de datos accesible a toda la comunidad cient¨ªfica que permita reproducir y validar la informaci¨®n en diferentes entornos y producir beneficios para la salud p¨²blica.

"Sabemos que el microbioma modula la respuesta de nuestro sistema inmunitario; incluso la respuesta a los tumores est¨¢ regulada por la diversidad de nuestra flora normal. Pensar que esta interact¨²a con el microbioma urbano es un aspecto interesante a tener en cuenta en futuras investigaciones", a?ade Pasquinelli.

Este art¨ªculo ha sido producido por la secci¨®n de Latinoam¨¦rica y el Caribe de SciDev.Net y editado.