'Hoy ning¨²n sistema puede ser exhaustivo'

Iro Tanaka es el director de Bioinform¨¢tica de Genset, una de las m¨¢s importantes empresas gen¨¦ticas europeas y el principal responsable de la nomenclatura de genes.

Pregunta. ?C¨®mo determinan en Genset los nombres de los genes cuando son descubiertos?

Respuesta. Hemos hecho igual que en el mundo acad¨¦mico del que procede cada cual. Hemos dado un nombre a los genes seg¨²n su funci¨®n o bien d¨¢ndoles un n¨²mero precedido por la letra G. Todos los laboratorios han tenido su propia pol¨ªtica de atribuci¨®n de nombres: a base de colores para los genetistas de la drosofila, haciendo a menudo referencia a un fenotipo, es decir, a un car¨¢cter, en el idioma del descubridor, lo que hace que los nombres de estos genes puedan ser muy ex¨®ticos; m¨¢s a menudo, el nombre hace referencia a la funci¨®n..., pero ¨¦sta puede estar equivocada. Por ¨²ltimo, otros investigadores les dan su nombre de pila: John 1, John 2. El resultado es que los genes que ejercen la misma funci¨®n en diferentes organismos la mayor¨ªa de las veces tienen varias denominaciones, en ocasiones hasta 25.

P. Esta falta de homogeneidad, ?es molesta para la industria?

R. Terriblemente, y mucho m¨¢s que en el sector acad¨¦mico. Cada investigador de un laboratorio p¨²blico se interesa por un n¨²mero muy reducido de genes de los que conocen r¨¢pidamente todos los nombres. Nosotros nos interesamos por muchos genes y disponemos de un sistema autom¨¢tico de bibliograf¨ªa que busca en la literatura y en los bancos de genes. Por eso, nos faltan muchas informaciones ya que a menudo el gen cambia de nombre numerosas veces.

P. ?Qu¨¦ opina de la iniciativa del consorcio Genetic Ontology?

R. He de confesar que no conozco este consorcio. Pero es una buena idea desarrollar un sistema de anotaci¨®n de los genes basado en su funci¨®n, los procesos biol¨®gicos en los que participan y la localizaci¨®n de la prote¨ªna correspondiente dentro de la c¨¦lula. Ser¨ªa el sistema de anotaci¨®n m¨¢s completo. Nosotros utilizamos bancos p¨²blicos de genes anotados, en especial del NCBI y del instituto Weitzman, que cuentan con ficheros de genes con el nombre asociado a su funci¨®n. Pero, hoy por hoy, ning¨²n sistema puede pretender ser exhaustivo y siempre utilizamos varios.

P. ?Conf¨ªa en el ¨¦xito de este tipo de iniciativas?

R. Por desgracia, en absoluto. Este esfuerzo es muy loable, pero la cantidad de informaciones ya acumulada es tal que temo que asistamos a una superposici¨®n de nomenclatura.