El an¨¢lisis gen¨¦tico sugiere que el coronavirus ya circulaba por Espa?a a mediados de febrero
Un estudio de los 28 primeros genomas del virus descarta la existencia de un ¡®paciente cero¡¯ espa?ol
Cuatro p¨¢ginas de peri¨®dico tienen el mismo n¨²mero de letras que el c¨®digo gen¨¦tico del nuevo coronavirus: 30.000. En ese breve texto hay suficiente informaci¨®n como para poner de rodillas a la humanidad entera y obligar a miles de millones de personas a esconderse en sus casas. Una vez que infecta una c¨¦lula humana, por ejemplo de la garganta, el virus es capaz de hacer hasta 100.000 copias de s¨ª mismo en apenas 24 horas. En cada copia pueden surgir peque?os errores ¡ªde una letra por otra¡ª que los nuevos virus van heredando igual que los monjes medievales repet¨ªan las erratas al copiar un libro manuscrito. Y estudiando esas erratas v¨ªricas se puede reconstruir la historia de la pandemia.
Un equipo de cient¨ªficos del Instituto de Salud Carlos III, en Madrid, ha analizado ahora los 28 primeros genomas del virus le¨ªdos en Espa?a. El rastro de las erratas no conduce a un ¨²nico paciente cero, sino que confirma ¡°multitud de entradas¡± de personas infectadas desde otros pa¨ªses durante el mes de febrero, seg¨²n explica el bioinform¨¢tico Francisco D¨ªez, primer firmante del estudio. El 23 de febrero, el coordinador de Emergencias del Ministerio de Sanidad, Fernando Sim¨®n, afirm¨®: ¡°En Espa?a ni hay virus ni se est¨¢ transmitiendo la enfermedad ni tenemos ning¨²n caso actualmente¡±. Pero parece que para entonces el virus ya campaba a sus anchas.
El equipo de D¨ªez ha estudiado los casi 1.600 genomas completos del virus le¨ªdos por la comunidad cient¨ªfica internacional hasta finales de marzo. El an¨¢lisis muestra que los 28 genomas espa?oles pertenecen a las tres grandes familias del virus identificadas en el resto de mundo y bautizadas S, G y V, con poca diversidad entre ellas. ¡°Todos los virus son muy parecidos, en principio, con pocas mutaciones de diferencia, lo que es una buena noticia, con todas las cautelas¡±, explica D¨ªez, que ahora trabaja en el Hospital Cl¨ªnic de Barcelona. Las vacunas experimentales que se est¨¢n investigando hoy est¨¢n concebidas para la secuencia gen¨¦tica actual del virus. Una alta tasa de mutaci¨®n podr¨ªa arruinar la eficacia de las primeras vacunas, que llegar¨¢n como pronto dentro de un a?o.
El ¨¢rbol geneal¨®gico de algunos
casos espa?oles
Un an¨¢lisis de 28 genomas completos del
SARS-CoV-2 ha identificado tres familias del
virus en Espa?a: S, G y V. Los datos gen¨¦ticos
sugieren que el virus S ya circulaba por Espa?a
a mediados de febrero.
Nov.
Febrero
Marzo
24
1
9
18
28
9
18
Shangh¨¢i
Wuhan
Madrid
Francia
Francia
Valencia
Valencia
Valencia
Valencia
Georgia
Santiago de Ch.
Brasil
Santiago de Chile
Valencia
Pa¨ªses Bajos
Estados Unidos
Madrid
Valencia
Castilla y Le¨®n
Valencia
Valencia
Fuente: D¨ªez Fuertes y otros.
EL PA?S
El ¨¢rbol geneal¨®gico de algunos
casos espa?oles
Un an¨¢lisis de 28 genomas completos del
SARS-CoV-2 ha identificado tres familias del virus
en Espa?a: S, G y V. Los datos gen¨¦ticos sugieren
que el virus S ya circulaba por Espa?a
a mediados de febrero.
Nov.
Febrero
Marzo
24
1
9
18
28
9
18
Shangh¨¢i
Wuhan
Madrid
Francia
Francia
Valencia
Valencia
Valencia
Valencia
Georgia
Santiago de Chile
Brasil
Santiago de Chile
Valencia
Pa¨ªses Bajos
Estados Unidos
Madrid
Valencia
Castilla y Le¨®n
Valencia
Valencia
Fuente: D¨ªez Fuertes y otros.
EL PA?S
El ¨¢rbol geneal¨®gico de algunos casos espa?oles
Un an¨¢lisis de 28 genomas completos del SARS-CoV-2 ha identificado tres familias del virus
en Espa?a: S, G y V. Los datos gen¨¦ticos sugieren que el virus S ya circulaba por Espa?a
a mediados de febrero.
Noviembre
Febrero
Marzo
24
1
9
18
28
9
18
Shangh¨¢i
Madrid
Wuhan
Francia
Francia
Valencia
Valencia
Alrededor del
14 de
febrero
Valencia
Valencia
Georgia
Santiago de Chile
Brasil
Santiago de Chile
Valencia
Pa¨ªses Bajos
Estados Unidos
Madrid
Valencia
Castilla y Le¨®n
Valencia
Valencia
Fuente: D¨ªez Fuertes y otros.
EL PA?S
El nuevo an¨¢lisis, publicado sin revisi¨®n externa en un repositorio abierto, sugiere que el ancestro com¨²n de los 1.600 virus estudiados se encontraba en la ciudad china de Wuhan alrededor del 24 de noviembre. Trece de los genomas espa?oles pertenecen a la familia S, y 11 de ellos est¨¢n vinculados a un caso anterior detectado el 1 de febrero en Shangh¨¢i. Los tres primeros S identificados en Espa?a son de muestras tomadas los d¨ªas 26 y 27 de febrero en Valencia. Una semana antes, 2.500 aficionados valencianistas hab¨ªan viajado a Mil¨¢n para ver el partido de f¨²tbol Atalanta-Valencia, calificado como ¡°una bomba biol¨®gica¡± por el alcalde de B¨¦rgamo, Giorgio Gori. Sin embargo, el an¨¢lisis gen¨¦tico sugiere que los coronavirus de la familia S ya circulaban por Espa?a incluso antes, alrededor del 14 de febrero. Otra agrupaci¨®n de media docena de casos de Madrid apunta a que la familia G ya circulaba por la capital en torno al 18 de febrero.
¡°Creemos que hubo al menos 15 entradas diferentes en Espa?a¡±, explica el genetista Fernando Gonz¨¢lez Candelas
El estudio permite comprobar la diseminaci¨®n invisible y explosiva del virus. El caso de Shangh¨¢i del 1 de febrero est¨¢ aparentemente emparentado con otras dos muestras tomadas en Francia el 25 y 26 de febrero, otra de Madrid del 2 de marzo, otra de Chile del 3 de marzo, otra de EE UU del 4 de marzo, otra de Georgia del 8 de marzo y otra de Brasil del 16 de marzo. Las probables rutas de transmisi¨®n se van complicando hasta formar una madeja en el mapamundi. D¨ªez cree que esta rama concreta del virus salt¨® desde Espa?a a otros seis pa¨ªses.
¡°En Espa?a no ha habido un paciente cero. No hay un paciente cero cuando una epidemia est¨¢ ya tan diseminada¡±, recalca el vir¨®logo Jos¨¦ Alcam¨ª, supervisor del trabajo junto a su colega Inmaculada Casas. El equipo del genetista Fernando Gonz¨¢lez Candelas, de la fundaci¨®n valenciana Fisabio, secuenci¨® los tres primeros genomas espa?oles del virus el 17 de marzo. Su grupo ya ha le¨ªdo m¨¢s de un centenar. ¡°Por la informaci¨®n que tenemos hoy, creemos que hubo al menos 15 entradas diferentes en Espa?a. Es algo parecido a lo que ha sucedido en otros pa¨ªses, como EE UU e Islandia, donde tambi¨¦n se han identificado m¨²ltiples entradas del virus¡±, se?ala Gonz¨¢lez. ¡°El paciente cero no existe¡±, zanja.
Gonz¨¢lez subraya las limitaciones de estos estudios gen¨¦ticos, basados en los genomas completos del virus publicados por la comunidad cient¨ªfica en el repositorio abierto Gisaid. Ya hay unos 11.000 genomas completos de medio mundo, 150 de ellos de Espa?a, pero faltan piezas esenciales. ¡°De Italia no hay secuencias relevantes para poder sacar conclusiones¡±, lamenta Gonz¨¢lez. Al faltar estos genomas, quedan invisibilizadas posibles rutas de transmisi¨®n desde Italia al resto del mundo. Adem¨¢s, la fotograf¨ªa siempre es incompleta: hay 2,4 millones de casos confirmados en el planeta, seg¨²n los ¨²ltimos datos de la Organizaci¨®n Mundial de la Salud.
El genetista de Fisabio, que no ha participado en el nuevo estudio, es esc¨¦ptico con la conclusi¨®n de que el virus ya circulaba por Espa?a a mediados de febrero. Se puede calcular el momento en el que se produce la divergencia del ancestro com¨²n de una familia de virus, pero ¡°no se puede afirmar que esa divergencia se produzca en Espa?a¡±, advierte. ¡°Como no hay secuencias de Italia, que es de donde creo que vienen casi todas las primeras infecciones de esa familia ¡ªpero tampoco lo afirmo porque no tengo los datos necesarios¡ª, no es posible verificarlo con fiabilidad¡±, a?ade el genetista, que pide que no se usen para ¡°la bronca pol¨ªtica¡± datos cient¨ªficos con este nivel de incertidumbre. Gonz¨¢lez, no obstante, es optimista al ver la poca diversidad del virus. ¡°El SARS-CoV-2 tiene un ritmo de mutaci¨®n 1.000 veces m¨¢s lento que el de la gripe o el VIH. En principio, eso es una buena noticia¡±, celebra.
82 d¨ªas desde el primer caso conocido
Solo han pasado 82 d¨ªas desde que el 1 de febrero se detect¨® el primer caso en Espa?a, el de un turista alem¨¢n en la isla canaria de La Gomera. El hombre estaba vinculado a uno de los primeros brotes conocidos en Europa, el de un grupo de empleados de la empresa de productos automovil¨ªsticos Webasto que participaron en un curso de formaci¨®n en M¨²nich junto a una compa?era china, con familia en Wuhan. El segundo caso en Espa?a, un ciudadano brit¨¢nico que se contagi¨® en los Alpes, se confirm¨® el 10 de febrero en Palma de Mallorca. Ambos casos fueron aislados y dados pronto de alta, as¨ª que el 23 de febrero las autoridades sanitarias pensaban que Espa?a estaba limpia de virus.
El coronavirus, sin embargo, ya estaba circulando desde hac¨ªa muchos d¨ªas, seg¨²n sugieren ahora los datos gen¨¦ticos y epidemiol¨®gicos. ¡°Ninguna frontera ha podido parar al virus¡±, subraya el genetista Fernando Gonz¨¢lez Candelas, de la fundaci¨®n Fisabio. El Centro Europeo para la Prevenci¨®n y el Control de las Enfermedades (ECDC) alert¨® el 18 de enero de que el aeropuerto de Wuhan ten¨ªa seis vuelos semanales directos a Par¨ªs, tres a Londres y otros tres a Roma. As¨ª viajaron multitud de pacientes cero.
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