La supercomputaci¨®n har¨¢ m¨¢s asequible el tratamiento del c¨¢ncer
Un m¨¦todo computacional dise?ado en Barcelona permite analizar los cambios gen¨¦ticos en pacientes de c¨¢ncer en pocas horas, un paso hacia el tratamiento personalizado
Hace algunos a?os, no era raro escuchar que algunas celebridades con c¨¢ncer viajaban hasta Houston (EE UU) para ponerse en manos de los mejores especialistas en la enfermedad. Aquellos m¨¦dicos ser¨ªan capaces de ofrecer el diagn¨®stico m¨¢s preciso y recomendar el tratamiento m¨¢s adecuado. El prestigio de la sanidad espa?ola ha hecho menos populares aquellos viajes, pero las diferencias entre los profesionales de unos centros y otros dentro de Espa?a hace que las variaciones en supervivencia entre hospitales del mismo pa¨ªs a¨²n sean importantes.
Ahora, un nuevo avance que acaba de presentar un equipo liderado por el Centro de Supercomputaci¨®n de Barcelona puede ayudar a dise?ar tratamientos m¨¢s personalizados contra el c¨¢ncer y hacerlo de una manera m¨¢s automatizada, de tal manera que a¨²n sin contar con los mejores especialistas se pueda aspirar a obtener los mejores resultados.
La base de este sistema ser¨ªa SMUFIN, un m¨¦todo computacional capaz de detectar alteraciones gen¨¦ticas relacionadas con la aparici¨®n de tumores que por ahora se podr¨¢ aplicar al campo de la investigaci¨®n. Este m¨¦todo, que hoy se publica en la revista Nature Biotechnology, permite comparar el genoma de c¨¦lulas sanas de un paciente con el de sus c¨¦lulas cancerosas. Con esa informaci¨®n, es posible identificar las mutaciones de un tumor concreto a las que se puede culpar de la aparici¨®n de la enfermedad.
El tratamiento para un c¨¢ncer como el de mama no es ¨²nico
Esto permitir¨ªa aplicar un tratamiento dise?ado m¨¢s o menos a medida para un tipo de c¨¢ncer de una persona, porque la variabilidad y capacidad de adaptaci¨®n de las c¨¦lulas cancer¨ªgenas hace que no solo se requieran tratamientos distintos para tratar tumores diferentes como el de pulm¨®n o el de p¨¢ncreas sino que los c¨¢nceres que afectan a un mismo ¨®rgano pueden reaccionar de manera diferente a un mismo tratamiento.
"Entre todas las personas que tengan un tumor de mama, cada una de ellas tendr¨¢ un origen diferente y es clave conocer este origen para desarrollar terapias espec¨ªficas para cada persona", explica David Torrents, profesor de investigaci¨®n ICREA en el BSC y autor principal del trabajo. Este tipo de tecnolog¨ªa es un paso hacia la medicina personalizada, que mejorar¨ªa los resultados de tratamientos actuales como la quimioterapia, que da?an al c¨¢ncer, pero tambi¨¦n a las c¨¦lulas sanas.
Con este nuevo enfoque, a un paciente diagnosticado de c¨¢ncer se le extraer¨ªan c¨¦lulas sanas y c¨¦lulas del tumor, se secuenciar¨ªa el genoma de los dos tipos de c¨¦lulas y se comparar¨ªa para identificar qu¨¦ tumores han provocado el c¨¢ncer. Seg¨²n la mutaci¨®n afecte a un gen o a otro, esa informaci¨®n se emplear¨ªa para elegir el f¨¢rmaco m¨¢s eficaz para actuar contra esa diana concreta. "Ahora tambi¨¦n es tarea de las farmac¨¦uticas encontrar estos f¨¢rmacos m¨¢s espec¨ªficos para poder aplicar a cada tipo de diana", apunta Torrents.
De una semana a cinco horas
Hasta ahora, este tipo de an¨¢lisis eran posibles, pero estudiar un solo tumor pod¨ªa tomar hasta una semana. "Nosotros lo estamos haciendo ahora entre cinco y diez horas", afirma Torrents. Adem¨¢s, con SMUFIN se pueden detectar cambios en el genoma que para sistemas de an¨¢lisis anteriores permanec¨ªan ocultos.
Los m¨¦todos anteriores eran m¨¢s costosos y requer¨ªan mucho personal, en particular inform¨¢tico. "Para dar el salto a la cl¨ªnica era necesario ganar en rapidez, sencillez y flexibilidad", se?ala Torrents. SMUFIN, seg¨²n sus autores, facilitar¨¢ aplicar la tecnolog¨ªa de secuenciaci¨®n y comparaci¨®n de genomas a centros que no cuenten con expertos en inform¨¢tica ni grandes recursos computacionales.
Por ¨²ltimo, la informaci¨®n sobre las mutaciones de una c¨¦lula tumoral se podr¨¢ cruzar con una base de datos que indique qu¨¦ f¨¢rmacos son m¨¢s eficaces para mitigar los cambios que producen esas mutaciones y acaban desembocando en un c¨¢ncer. Esta etapa, que va m¨¢s all¨¢ del art¨ªculo publicado hoy, adem¨¢s de mejorar la medicina personalizada, pondr¨ªa a disposici¨®n de mucha m¨¢s gente y a un precio mucho m¨¢s bajo diagn¨®sticos precisos para cada dolencia particular.
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