Las pistas del ADN del virus del Nilo de 2020 pueden ayudar a su erradicaci¨®n
La primera secuenciaci¨®n del genoma, realizada por cient¨ªficos andaluces, baraja dos hip¨®tesis sobre su origen, constata dos mutaciones y puede determinar si es end¨¦mico si se coteja con el brote actual
El brote del virus del Nilo Occidental que el a?o pasado se cobr¨® la vida de ocho personas (todas en Andaluc¨ªa) y afect¨® a otras 71 sorprendi¨® a los epidemi¨®logos por lo inesperado y por su virulencia. El primer estudio gen¨¦tico de esas cepas, liderado por investigadores y cient¨ªficos andaluces, puede ayudar a determinar no solo su origen, sino su potencial agresividad y lo que es m¨¢s importante, si puede considerarse una variante end¨¦mica de la cuenca del Guadalquivir o si procede del exterior, una evidencia esencial de cara a actuar sobre su erradicaci¨®n o anticiparse a su aparici¨®n.
Las conclusiones del trabajo, publicadas en la revista Viruses, apuntan a dos hip¨®tesis sobre su origen: ¡°Una presencia com¨²n y diversificada en el Mediterr¨¢neo y que va apareciendo en distintas zonas o un reservorio end¨¦mico viral end¨¦mico de Italia que parece estar permanentemente activo y con brotes continuos desde 2008 y que ya se ha introducido en otras ocasiones en Espa?a¡±, indica el documento sobre el an¨¢lisis filogen¨¦tico. ¡°Si tuvi¨¦ramos datos de ADN intermedios entre las secuencias de este brote y las muestras de los otros posibles or¨ªgenes, ser¨ªa m¨¢s f¨¢cil llegar a una conclusi¨®n, pero lo cierto es que hay grupos de virus emparentados que son end¨¦micos de Italia y que han pasado por Espa?a¡±, indica Joaqu¨ªn Dopazo, director del ?rea de Bioinform¨¢tica Cl¨ªnica de la Fundaci¨®n Progreso y Salud, dependiente de la Junta de Andaluc¨ªa, que ha dirigido la investigaci¨®n y que llama la atenci¨®n sobre la escasa informaci¨®n gen¨¦tica sobre otros brotes y la presencia anterior del virus del Nilo Occidental en Espa?a.
La aparici¨®n de un nuevo brote infeccioso este a?o, en los mismos humedales donde apareci¨® en 2020 ¡ªque ya se ha cobrado una v¨ªctima mortal y ha provocado dos contagios, que han sido dados de alta¡ª, puede ayudar a despejar inc¨®gnitas. ¡°Si conseguimos hacer otra secuenciaci¨®n de este brote y comprobamos que es id¨¦ntica al del a?o pasado, nos permitir¨ªa concluir si es end¨¦mico de Andaluc¨ªa¡±, sostiene Dopazo. Esta evidencia, estima el investigador, podr¨ªa llevar a dar con los focos y erradicarlos, m¨¢s all¨¢ de las actuales medidas de prevenci¨®n que puso en marcha la Junta de Andaluc¨ªa hace un a?o para contener la presencia del mosquito del g¨¦nero Culex que es el que sirve de vector para la inoculaci¨®n del virus en animales y personas. ¡°Es importante haber conseguido una secuenciaci¨®n gen¨¦tica de la cepa de 2020 porque estos virus mutan y desaparecen¡±, incide Dopazo.
La aparici¨®n de un nuevo brote infeccioso este a?o, en los mismos humedales donde apareci¨® en 2020 puede ayudar a despejar inc¨®gnitas
El estudio se ha realizado sobre cuatro muestras identificadas del brote del a?o pasado que pertenecen al linaje 1 ¡ªde los ocho en los que se clasifica filogen¨¦ticamente el virus del Nilo Occidental¨D. Tres de ellas presentan mutaciones en las prote¨ªnas. Dos en la prote¨ªna de la envoltura de virus y otra que se produce en el punto de escisi¨®n de la prote¨ªna, lo que ¡°puede explicar el aumento de la transmisibilidad e incluso la mortandad de la infecci¨®n¡±, se explica en el documento. ¡°Todo es muy especulativo, porque de este virus se sabe bastante poco¡±, advierte Dopazo.
¡°No sabemos todav¨ªa la importancia de esas mutaciones o si pueden indicar que sea m¨¢s peligrosa, porque no hay experimentaci¨®n suficiente, pero se trata de una llamada de atenci¨®n¡±, se?ala el investigador. ¡°Los virus van mutando y las mutaciones que preocupan son las que hacen que se conviertan en m¨¢s graves, pero no podemos determinar si la virulencia del brote es por la peligrosidad de la mutaci¨®n o porque la cepa est¨¦ m¨¢s extendida y afecte a m¨¢s personas¡±, a?ade. Son las aves, recuerda Dopazo, las principales transmisoras del mosquito, que luego infecta a animales y a humanos. ¡°La expansi¨®n podr¨ªa deberse a una mayor llegada de aves y no a la virulencia del virus¡±, abunda.
El mosquito Culex es com¨²n en los pantanales del r¨ªo Guadalquivir. Los municipios ribere?os ¡ªcomo Coria del R¨ªo o la Puebla del R¨ªo, en Sevilla¨D fueron los m¨¢s afectados por el brote de 2020 (aunque tambi¨¦n se dieron casos en la provincia de Badajoz), y son en los que han aparecido los ¨²ltimos casos de infecciones graves en seres humanos. El virus del Nilo provoca un 0,1% de las muertes entre los contagiados, un 20% de fiebre controlable y un 80% de casos asintom¨¢ticos, seg¨²n los datos de la Organizaci¨®n Mundial de la Salud.
Todos los resultados del estudio se encuentran disponibles en una plataforma vinculada al Sistema de Vigilancia Epidemiol¨®gica de Andaluc¨ªa, que se ha convertido en una herramienta fundamental para la vigilancia epidemiol¨®gica en la regi¨®n y en la que se insertar¨¢n otros an¨¢lisis del genoma de otras muestras medioambientales y de futuros brotes. Este servidor ha sido desarrollado por el ?rea de Bioinform¨¢tica de la fundaci¨®n Progreso y Salud como parte del proyecto del estudio del ADN del virus del Nilo y muestra, de manera interactiva, la filogenia completa de las cuatro secuencias analizadas del brote de 2020 en el contexto del resto de brotes mundiales que se han analizado previamente.
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